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系统科学与工程专业毕业生认为该专业发展前景很好和比较好的比例为28%，19%的毕业生认为该专业发展前景为“不太好”或“很不好”。按照10分制进行计算，该专业的发展前景指数为6.16，与其他专业相比，发展前景指数为中等。
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系统科学与工程专业毕业生能在电子信息、生物工程、通信、计算机、电子商务、电气工程、电力工程、交通、金融、机械以及轻纺等广泛领域从事系统分析、设计、科学研究开发和管理决策工作。毕业生进一步深造，每年有50%左右毕业生通过免试保送或考试攻读研究生，部分优秀学生可直攻博士学位。
系统科学与工程专业毕业生能在电子信息、生物工程、通信、计算机、电子商务、电气工程、电力工程、交通、金融、机械以及轻纺等广泛领域从事系统分析、设计、科学研究开发和管理决策工作。系统工程及相关学科的"教学和科研工作;国家机关、军事系统等的系统规划、设计和管理工作;工厂、企业、工程项目的生产系统从事设计规划、设计和管理工作;铁路和城市轨道交通行业、系统工程、交通运输工程、管理科学与工程、电气工程，以及与工业自动化密切相关的企事业单位和研究机构和大专院校。
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